يسعى القسم إلى الريادة في دراسة ومكافحة أمراض ما بعد الحصاد لحماية المنتجات الزراعية وتقليل الفاقد. يركز على تطوير منظومة متكاملة تجمع بين البحث العلمي والتشخيص الدقيق، مع دراسة تأثير التغيرات المناخية والاقتصادية. كما يطمح ليكون مركزًا للتميز في تدريب الكوادر وتقديم الاستشارات العلمية لتحقيق التنمية الزراعية المستدامة.