يتفاعل الماسح الضوئي مع تطبيقات برامج الكمبيوتر لتنفيذ المهام.  يتم استيراد البيانات من الماسح الضوئي إلى هذه التطبيقات.  تحتوي معظم الماسحات الضوئية على برنامج مسح أساسي يجعل المستخدمين قادرين على تكوين عمليات المسح وبدءها واستيرادها.  تستطيع الماسحات الضوئية أيضًا استيراد الصور الممسوحة ضوئيًا مباشرةً من خلال برامج مختلفة.