ويأتي الأمن الفكري على رأس قائمة الغايات الهامة لتكون حماية المجتمع عامة والشباب خاصة في البلاد المسلمة من الأفكار الدخيلة الهدامة واجباً شرعياً، وتمكن تلخيص أهمية الأمن الفكري في النقاط التالية:
 1 - أن الأمن الفكري يحقق للأمة أهم خصائصها،  وذلك بتحقيق التلاحم والوحدة في الفكر والمنهج والغاية. 2- أنه في غياب الأمن الفكري سيكون هناك خلل في الأمن في جميع فروعه. 3- أن الفكر في هذه الأمة يستمد جذوره من عقيدة الأمة ومسلماتها وثوابتها وهو الذي يحدد هويتها وشخصيتها وذاتيتها. 4- أن تحقيق الأمن الفكري هو المدخل الحقيقي للإبداع والتطور والنمو الحضارة المجتمع وثقافته. 5-أن في تحقيقه حماية للمجتمع عامة وللشباب خاصة ووقاية لهم مما يرد عليهم من أفكار دخيلة هدامة. 6 - أن الأمن الفكري يبحث في كيفية التصدي للجريمة عامة وجرائم العنف خاصة.  لأن الغاية التي يتفق عليها جميع أعداء الإسلام هي الطعن والتشكيك فيه. تلك أهم ملامح أهمية الأمن الفكري في حياة الفرد والمجتمع والأمة،  مما يحتم العناية والاهتمام به من جميع شرائح الأمة وأطياف المجتمع.