13] قيل إن لقبه القَرشي نسبة إلى القرش،  حيث ذكر ابن أبي أصيبعة أنها قرية قرب مدينة دمشق، 14] وتذكر دائرة المعارف الإسلامية أنه ولد على مشارف غوطة دمشق، 15] والراجح أنه من قبيلة قريش من بني مخزوم من الخوالد،  كما كان ابن النفيس معاصرًا لمؤرخ الطب الشهير ابن أبي أصيبعة،  ودرس معه الطب على ابن الدخوار. 16]
 وقد درس ابن النفيس أيضًا الفقه الشافعي،  وكان مهتمًّا بالتفسير العقلاني للوحي.  وخلافًا لبعض معاصريه والسلف، 17] كما درس اللغة والمنطق والأدب. هناك اختلاف حول تاريخ انتقاله إلى القاهرة،  إلا أنه يمكن تقدير ذلك في الفترة بين عامي 633 هـ (1236م) و636 هـ (1239م)[18] وعند انتقال ابن النفيس للقاهرة عمل في المستشفى الناصري،  حيث أصبح «رئيسًا للأطباء». 20] كما أصبح طبيبًا خاصًا للسلطان الظاهر بيبرس بين عامي 1260 و1277. 20]
  وفرش أرضها بالرخام حتى إيوانها.