تتولى هذه الهيئة الرقابة على نشاطات البنك أو المؤسسة المالية المتعلقة بالصيرفة الإسلامية و لعل مجال ممارسة مهمتها الرقابية يكون ضمن : 
 -	إيجاد المزيد من الصيغ الشرعية المناسبة للمصرف الاسلامي لمواكبة التطور في الأساليب والخدمات المصرفية. -	المراجعة الشرعية لكل ما يقترح من اساليب استثمار جديدة. -	وضع القواعد اللازمة لضبط التعامل مع البنوك غير الاسلامية. -	اعداد دليل عملي شرعي ،  وحسابات الاستثمار ،  ومرورا بعمليات التمويل في المرابحة والمضاربة وانتهاء بأشكال الخدمات المصرفية من حوالات وفتح اعتمادات ،  وتكمن أهمية هذا الدليل في كونه يسهل توحيد المنهج والضبط والمراقبة ،  ويعمل كذلك على تنمية الوعي لدى العاملين بحيث يحيطون بالأسس الشرعية الحاكمة للعمل المصرفي الاسلامي ويعين هيئة الفتوى لمعرفة ما وراء العمال المصرفية من ارتباطات تعاقدية. -	المراجعة الشرعية لجميع مراحل تنفيذ العملية الاستثمارية وابداء الملاحظات في جميع مراحل تنفيذ العملية الاستثمارية.