تعتبر كل من مشكلة الحث العلمي و الفرضيات خطوتان مهمتان في نموذج البحث العلمي في تميز الابحاث العلمية عن بعضها البعض لذا يختلف كل نموذج بحث عن الاخر بإختلاف المشكلة التي يقدمها و الفرضيات التي يعالجها  حيث يعمل الباحث العلمي على قراءة النظريات المتعلقة بتخصصه و من ثم صياغة مشكلة نموذجية لخطة البحث على ان تكون تلك المشكلة هي جوهر البحث العلمي الذي يقدمه