وُلد الشيخ محمد «الابن الثالث للشيخ راشد بن سعيد آل مكتوم» في 15 يوليو عام 1949،  وأخذ عن والده المهارات الأساسية للفروسية.  تلقَّى مبادئ اللغة العربية وتعاليم الدين الإسلامي،  ثم التحق بكلية مونز العسكرية البريطانية في ألدرشوت،  والتي هي اليوم جزء من أكاديمية ساندهيرست العسكرية الملكية.