عيوب تقنية تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR):
  مما قد يُؤدي إلى نتائج خاطئة.  وتتطلب خبرةً متخصصةً في المشاريع ذات الإنتاجية العالية.  ولا يُمكنها الكشف عن تسلسلات DNA جديدة.  مثل الهيم الموجود في عينات الدم، 5. أخطاء التضخيم: قد تُؤدي استبدالات القواعد، بشكل عام،  ولكن يجب اتخاذ تدابير دقيقة لضمان الجودة عند تصميم تجارب PCR وتفسير نتائجها.