خدم كليبر في راينلاند أثناء حرب التحالف الأول، كما شارك في قمع تمرد الملكيين في إقليم الفونديه. قبل أن يتقاعد لفترة وجيزة بعد معاهدة كامبو فورميو، عاد إلى العسكرية ليرافق نابليون في حملته على مصر بين عامي 1798–1799. وعندما غادر نابليون مصر عائداً إلى باريس، عيّن كليبر قائداً للحملة خلفاً له.