تهدف وزارة البيئة في المملكة العربية السعودية إلى حماية البيئة البحرية والساحلية بشكل مستدام،  تعمل المملكة على توسيع المناطق البحرية المحمية وزيادة الوعي بأهمية الحفاظ على البيئة البحرية،  وتنظيم الأنشطة المقامة في البيئة البحرية أو على الشريط الساحلي،  وإنشاء مناطق بحرية محمية للمحافظة على التنوع البيولوجي وتنميته و تمتلك المملكة العربية السعودية وفرة من التنوع الأحيائي والنظم البيئية البحرية ذات أهمية قصوى في مياه البحر الأحمر والخليج العربي،  وتكمن مسؤولية المركز في المحافظة على البيئة البحرية والساحلية من خلال الحفاظ على الموائل البحرية وإعادة تأهيلها والعمل على استدامة الكائنات والنظم البيئية البحرية.