يتألف هيكل صندوق النقد الدولي من ثلاثة أجهزة رئيسية: مجلس المحافظين، المجلس التنفيذي، والمدير العام.  يمثل مجلس المحافظين، المؤلف من ممثلين عن كل الدول الأعضاء (185 دولة)، السلطة العليا، ويتخذ قرارات السياسات الرئيسية، مُفوضاً المجلس التنفيذي باتخاذ القرارات اليومية.  يجتمع مجلس المحافظين سنوياً، وينظر في قضايا السياسات الأساسية مرتين سنوياً عبر لجنة الشؤون النقدية والمالية ولجنة التنمية.  يتألف المجلس التنفيذي من مدراء، برئاسة المدير العام، ويجتمع ثلاث مرات أسبوعياً في واشنطن.  تُخصص مقاعد مستقلة فيه للبلدان المساهمة الكبرى، بينما يُنتخب المدراء الآخرون من مجموعات من الدول.  يُنتخب المدير العام لمدة خمس سنوات قابلة للتجديد، ويرأس المجلس التنفيذي، ويُدير عمل الصندوق بمساعدة نوابه.  يقوم موظفو الصندوق، غالبيتهم من الاقتصاديين، بإعداد وثائق المجلس التنفيذي،  والتي تُتاح نسبة متزايدة منها للجمهور عبر الإنترنت.  يعتمد الصندوق نظام تصويت مُرجّح بناءً على الحصص المالية للدول، مع اعتماد معظم القرارات على توافق الآراء.  موظفو الصندوق مدنيون دوليون، ويعمل معظمهم في واشنطن، مع ممثلين مقيمين في الدول الأعضاء، ومكاتب اتصال في باريس، طوكيو، والأمم المتحدة.