	معالجة مدافن النفايات: تُستخدم المعالجة الحيوية للتحكم في ارتشاحات مدافن النفايات (Leachate) التي تحتوي على تركيزات عالية من الملوثات العضوية وغير العضوية،  مما يمنع وصولها إلى المياه الجوفية. 	تحسين جودة مياه الشرب: على الرغم من أن المعالجة الحيوية تُستخدم بشكل أساسي في استعادة المياه الجوفية،