تتمحور الرقابة المالية، مهما تعددت أهدافها، حول هدفين رئيسيين:  التحقق من مطابقة الإنفاق للخطط الموضوعة، ومن حصول الموارد واستخدامها الأمثل.  ويتحقق ذلك عبر عدة إجراءات:  التأكد من قانونية تحصيل الموارد (الضرائب والرسوم) وعدم وجود مخالفات، ومطابقة الإنفاق مع الموازنة العامة، ومتابعة تنفيذ الخطط وتقييم أداء الوحدات، والكشف عن أي انحرافات،  والتأكد من سلامة وتطبيق القوانين والأنظمة المالية، بالإضافة إلى تقييم الخطط والسياسات المالية والاقتصادية لتحقيق أهداف الدولة والالتزام بها.