أصيب السلطان قابوس بمرض سرطان القولون عام 2014م، وفي عام 2019م سافر إلى بلجيكا لتلقي العلاج، مما أثار الشائعات بأن أيامه أصبحت معدودة، وتم الإعلان عن وفاته بتاريخ 10 يناير من عام 2020م، وقد ترك خلفه رسالة تحدد الخليفة من بعده،