- ملفات الوثائق المفردة نفسها غير ملائمة (صنعت من ورق خفيف سهل التمزق وكذلك الأمر بالنسبة للحوافظ. - عدم وجود أماكن ملائمة للموظفين والعاملين بالمخازن بعيداً عن اماكن حفظ الوثائق. تلك هي بعض المشكلات التي عاني منها أرشيفنا القومي - ولا يزال- رغم ما شهده ويشهده حالياً من تطوير وتحديث،  ونحن نرغب في تعاون الجميع من أجل التغلب علي تلك المصاعب التي تواجه الأرشيف، تلك هي أهم السلبيات والمشاكل التي تعانيها الوحدات الأرشيفية المحفوظة بالدار منذ سنوات طويلة وحتي الآن,  وهذا كله بالاضافة إلي استحالة المحافظة علي تلك المجموعات وصيانتها بشكل علمي بسبب الأضرار الكبيرة التي تتعرض لها أثناء حفظها بمخازن الدار.  ولأنها كذلك تمثل  ذاكرة الوطن والمعين الأساسي لكل باحث ودارس ومستفيد في مجال الدراسات التاريخية والأبحاث العلمية,