يضر التدخين بكل أعضاء الجسم تقريبًا ويؤدي إلى الإصابة بالعديد من الأمراض،  يسبب التدخين مرض السكري،  وأمراض الرئة ومنها مرض الانسداد الرئوي المزمن،  يزيد التدخين من خطر الإصابة بمرض السل وبعض أمراض العيون ومشاكل الجهاز المناعي،  بما في ذلك مرض التهاب المفاصل الروماتويدي.