بدأ التعليم العالي في الأردن في الستينات بإنشاء كليات المعلمين لتلبية حاجة المدارس للمعلمين، تلتها إنشاء جامعة الأردن عام ١٩٦٢ ثم جامعة اليرموك عام ۱۹۷٦،  وتبعهما إنشاء ست جامعات أخرى. 

خطا التعليم الجامعي الأردني خطوة جريئة عام ۱۹۸۹ مع إقرار مجلس التعليم العالي لوثيقة سياسات تسمح بإنشاء جامعات خاصة، فظهرت جامعة عمان كأول جامعة خاصة عام ۱۹۹۰، تلتها اثنتا عشرة جامعة خاصة أخرى.

أنشئت وزارة التعليم العالي عام ۱۹۹۸ للإشراف على هذا التعليم، وأعيد تسميتها بوزارة التعليم العالي والبحث العلمي عام ۲۰۰۱. حدد هذا القانون أربعة أهداف استراتيجية للوزارة: تحسين إدارة قطاع التعليم العالي، تحسين جودة بيئة التعليم العالي، تطوير جودة البحث العلمي ودور مؤسسات التعليم العالي، وتوفير قاعدة بيانات ومعلومات عن الجودة القومية للتعليم العالي والدراسات والبحوث عن الممارسات والخبرات العالمية. 

تتضمن الأهداف الاستراتيجية للوزارة بشكل خاص الهدفين الثاني والثالث، البرامج التعليمية والبحثية للجامعات. 
وتتنوع الهيئات المسؤولة عن تطوير البرامج التعليمية بالجامعات الأردنية، ومن أبرزها وزارة التعليم العالي والبحث العلمي. 

تؤكد الأهداف الاستراتيجية الأربعة للوزارة على الجودة الشاملة،  الإدارة، البيئة، والمحتوى، بما في ذلك قواعد البيانات، والبرامج، والبحث العلمي. 

وتحقق الوزارة إشرافها على التعليم العالي وسياستها لتحقيق الجودة الشاملة من خلال مجلس التعليم العالي، الذي يمثل آلية التطوير على المستوى المركزي.