Lakhasly

مقال بحثي من ربط GroEL-BR وتلك الناتجة عن إزاحة الدهون والمنظفات التي أحاطت في الأصل بالجزء الكاره للماء BR. من المتصور أن الدهون والمنظفات المشردة من واجهات GroEL-BR إلى محلول سائب سترتبط مرة أخرى بالكسور الأخرى من خلال electect الكاره للماء، من وجهة النظر هذه، ومع ذلك، من أجل وكلاهما مسعور. هنا، أظهرنا أن تقارب BR ل GroEL يتم تعزيزه abour enold que o sus cenauradon على الرغم من أن المطابق الأصلي نفسه يظهر أيضا تقاربا كبيرا. وقد ظهر الربط متعدد التكافؤ بواسطة GroEL للعديد من البروتينات القابلة للذوبان غير الأصلية (Farr et al. 2000؛ بالمقارنة مع BR الأصلي الذي يضم هيكل (Krishnamani et al. 2012)، مما يسمح من المفترض أن GroEL بالارتباط بجزيء البروتين بأكمله من المتصور أن الضغوط التطورية، 2015، 2016) التي سيشرك فيها الهيكل الطويل مواقع ربط أكثر من الحالة المطوية وبالتالي تتمتع بميزة تنافسية في الارتباط ب GroEL مكدس إثبات أن BR واحد فقط، سواء تم تشويهه أم لا، يرتبط ب Grobl، وبالمثل، تحليل من السلبية بعد غسيل الكلى للمنظفات الذائبة (Sun et al. عام 2005). 2006). على غرار التعاونية بين الحلقات السلبية المعروفة الناجمة عن AlP (Gruber and Horovitz 2016)، على الرغم من أن الآلية الأساسية على المستوى الجزيئي لا يزال يتعين تحديدها يظهر apoGroEL تأثيرين معاكسين: خفض المعدل ولكن زيادة انتعاش البروتين المطوي في وجود DDM. على سبيل المثال، تفاعل BR غير الأصلي مع

مقال بحثي

من ربط GroEL-BR وتلك الناتجة عن إزاحة الدهون والمنظفات التي أحاطت في الأصل بالجزء الكاره للماء BR. لا يمكن أن يوفر قياس السعرات الحرارية للمعايرة معلومات عن الخصائص الديناميكية الحرارية لتفاعل الربط نفسه إلا إذا كانت مساهمة الكسور الأخيرة قليلة. من المتصور أن الدهون والمنظفات المشردة من واجهات GroEL-BR إلى محلول سائب سترتبط مرة أخرى بالكسور الأخرى من خلال electect الكاره للماء، بحيث لا ينبغي أن يكون تغير الطاقة الإجمالي المستمد من الإزاحة كبيرا.

وبالتالي، من المعقول افتراض أن تغيرات الطاقة التي لوحظت هنا ناتجة في المقام الأول عن تفاعل GroEL مع BR.

السمة المميزة الأكثر شيوعا لركائز GroEL هي وجود منطقة سورتاس مسعورة مكشوفة. من وجهة النظر هذه، لا توجد حدود يمكن تمييزها بين البروتينات القابلة للذوبان غير الأصلية التي تعرض بقايا كارهة للماء كبيرة وبروتينات الغشاء المشوهة.

ومع ذلك، من أجل

يقود حقا انتقال بروتين الغشاء trom الحالة المشوهة إلى الحالة nauve، يجب أن يكون urobl قادرا على التمييز بينهما، أي التفاعل بشكل تفضيلي مع الحالة المشوهة، وكلاهما مسعور.

هنا، أظهرنا أن تقارب BR ل GroEL يتم تعزيزه abour enold que o sus cenauradon على الرغم من أن المطابق الأصلي نفسه يظهر أيضا تقاربا كبيرا. من المحتمل أن يكون هذا بسبب تكافؤها الملزم المختلف مع حلقة غروت من سبعة مواقع ربط قمية، وقد ظهر الربط متعدد التكافؤ بواسطة GroEL للعديد من البروتينات القابلة للذوبان غير الأصلية (Farr et al. 2000؛ صلبيل

عام 2015|1

بالمقارنة مع BR الأصلي الذي يضم

حزمة مجمعة ضيقة من اللوالب. تحتوي حالتها المشوهة من SOs على أحماض أمينية معبأة بشكل فضفاض للغاية و residua. هيكل (Krishnamani et al. 2012)، مما يسمح من المفترض أن GroEL بالارتباط بجزيء البروتين بأكمله

من خلال المزيد من المواقع (التكافؤات) وإظهار ألينيتي أعلى وركيزة متحيزة سيليكوفيلي أثناء الطي بوساطة. من المتصور أن الضغوط التطورية، لتسهيل الإخبار، تؤدي إلى سبعة مواقع ربط غير متتالية في كل حلقة GroEL تضمن ليس فقط الربط الفعال عن طريق التفاعلات الكارهة للماء، ولكن أيضا التمييز في الركيزة من خلال الاكتماز الهيكلي. قد يكون هذا أيضا أحد الأسباب التي تجعل Grobl يمكن أن يكون imicienty

تعزيز طي الترجمة حديثا

البروتينات الغشائية (Chi et al. 2015، 2016) التي سيشرك فيها الهيكل الطويل مواقع ربط أكثر من الحالة المطوية وبالتالي تتمتع بميزة تنافسية في الارتباط ب GroEL

على الرغم من حقيقة أن GroEL يتكون من اثنين متتاليين

مكدس

حلقات متجانسة،

نتائجنا

إثبات أن BR واحد فقط، سواء تم تشويهه أم لا، يرتبط ب Grobl، مما يترك حلقة Grobl واحدة غير مشغولة بالبروتين. وبالمثل، BR الأصلي واثنين آخرين

X Lu وآخرون.

ثبت أن البروتينات الغشائية LacY والعاثية holin ترتبط بشكل غير متماثل ب GroEL باستخدام جسيم واحد

تحليل

من السلبية

مجمعات البروتين الملطخة-GroEL، بعد غسيل الكلى للمنظفات الذائبة (Sun et al. عام 2005). يتفق وضع الربط هذا مع الرأي السائد القائل بأن حلقتي GroEl تعملان بدلا من ذلك مثل محرك ثنائي الأشواط في مساعدة طي البروتينات القابلة للذوبان، مع حلقة واحدة فقط نشطة في أي وقت من الأوقات (Horwich et al.

2006). يشير التضافر السلبي بين الحلقات ل GroEl في بروتينات BR أو الركيزة الملزمة بشكل عام إلى أن entect أو البروتين المرتبط ينتقل عبر الحلقة ويغير وظيفة ربط البروتين للحلقة trans المفتوحة، على غرار التعاونية بين الحلقات السلبية المعروفة الناجمة عن AlP (Gruber and Horovitz

2016)،

على الرغم من أن الآلية الأساسية على المستوى الجزيئي لا يزال يتعين تحديدها

في الدراسات الحركية لطي BR، يظهر apoGroEL تأثيرين معاكسين: خفض المعدل ولكن زيادة انتعاش البروتين المطوي في وجود DDM.

قد تنجم هذه الآثار عن عملية سلبية تماما. على سبيل المثال، تفاعل BR غير الأصلي مع

يتنافس GrobL مع lolaing داخل الجزيئات، وبالتالي يبطئ معدل الطي، في حين أنه سيغير أيضا التقسيم الحركي بشكل إيجابي. من خلال الحفاظ على مستوى أقل من الطي الحر

إنتيميدلاتس،

تجميع

مخفض.

مما يؤدي إلى طي المزيد من البروتين إلى Sple lun وKve Luvo الأصلي. Tnis possiony قوي v مدعوم بقدرة GroEl على منع تجميع BR المشوهة SDs، كما كشفت عن ذلك Fus mea-surements. من ناحية أخرى، ثبت أن apoGroEl يمتلك نشاطا غير متولداز جوهري يتوسطه التفاعل الكاره للماء للوسيط القابل للطي مع قناة surlace للمجالات القمية GroEL (Libich et al. عام 2015). من المغري التكهن بأن apoGroEL قد تتكشف بالإضافة إلى ذلك أن contormers bk oll-pathway تغير bina بين الجزيئات: ing، ثم تطلقها في ميسيلات DDM حيث يمكن أن تحدث محاولات أخرى للطي الصحيح

تظهر نتائج Vur أنه في حين أن الجمع بين Groll وAlP يمكن أن يزيد بشكل كبير من كل من معدل و vield من BR refolding، فإن الجمع بين GroEL و Grobs له تأثير سلبي على العائد. هذا معقول عند الأخذ في الاعتبار وجود ol DDM micelles في محلول بالجملة الذي من شأنه أن يكون مفيدا ل bk relolaing و solubilizaton. من المعروف أن ربط Looperauve ل AlP بالوحدات الفرعية السبع لحلقة Grobl يحفز حركة صعودية وفي اتجاه عقارب الساعة أو api

مجالات كال المسؤولة عن ربط الركيزة (Skjaer-ven et al. عام 2015). قد يؤدي هذا التغيير الملتوي إلى إطلاق شرائح BR ضعيفة الارتباط، مع التوسط في توسيع الشرائح المقيدة بإحكام، يليها عن كثب المزيد من الإفراج عن BR وإعادة طيها التي يمكن أن تكون بسهولة