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1.Bacteries Materiel genetique Presence d'une membrane nucleaire ADN organise en chromosomes ADN associe a des proteines (histones) Division mitotique Presence de nucleol Absence de membrane nucleaire ADN en un seul chromosome ADN nu Division amitotique Absence de nucleoleActuellement, ils sont necessaires a la production du pain, du fromage, de la biere, des antibiotiques, des vaccins, des vitamines, des enzymes et de beaucoup de produits importants Les microorganismes sont des acteurs indispensables de notre environnement et permettent aux cycles de carbone, de l'oxygene et du souffre de fonctionner dans les milieux terrestres et aquatiques ; ils sont a l'origine de toutes les chaines alimentaires.Il presente en 1857 son fameux memoire ou il decrit le ferment lactique comme un organisme vivant, globuleux, beaucoup plus petit que la levure Pendant 20 ans, il poursuit inlassablement ses travaux sur d'autres fermentations (alcoolique en 1858, butyrique en 1861, acetique,....) et sur les maladies qui les affectent.Ces maladies sont dues a des contaminants que l'on peut detruire par chauffage a 56?C, procede universellement connu sous le nom de pasteurisation 1.3.2.Generation spontanee Pendant tres longtemps, les gens crurent a la generation spontanee : les organismes vivants pouvant se developper a partir de matiere non vivante ou en decomposition.Parmi elles, les algues et les champignons pouvaient etre rapproches de plantes, les premieres a cause de leur pouvoir de photosynthese, les seconds en raison de leur immobilite ; les protozoaires mobiles et non photosynthetiques etaient consideres comme des animaux ; la place des bacteries par contre restait a fixer 2De tres nombreux micro-organismes furent decrits durant le 18eme siecle et des tentatives de classification furent proposees.Definition LA MICROBIOLOGIE est un domaine d'etudes qui s'interesse aux organismes de taille microscopique, Micro-organismes, aussi appeles microbes et protistes Forment un ensemble des etres vivants invisible a l'oeil nu, C'est leur seul point commun, car ils different et varient par leur morphologie, leur physiologie, leur mode de reproduction et leur ecologie.En 1886, le zoologiste allemand Haeckel proposa une solution logique en demandant la creation, pour ses formes microscopiques, d'un troisieme regne, celui des protistes (qui signifie << les tout premiers (Protistos) >> en grec), qui rassemble les algues, les protozoaires, les champignons et les bacteries.Les deux autres morceaux de viande ne produisirent pas spontanement d'asticots Figure 1 : Experiences de Redi Cependant, les mouches attirees par le recipient couvert de gaze pondirent leurs oeufs sur la gaze ; mais ceux-ci ne se developperent pas en larves.Van Leeuwenhoek revela au monde scientifique la diversite des micro-organismes et l'incroyable richesse des milieux naturels, comme l'eau, en protozoaires, algues, levures, bacteries, qu'il les a ensuite appeles animalcules.Grace a leurs proprietes 3physiologiques et ecologiques tres diversifiees, les bacteries proliferent dans tous les types d'ecosystemes aquatiques et terrestres et colonisent tous les vegetaux et les animaux 3.Caracteristiques generales de la cellule procaryote La comparaison entre les deux types cellulaires montre qu'il y'a des differences fondamentales entre cellule eucaryote et procaryote.Certain d'entres eux possedent des flagelles ou une couche visqueuse (mucilagineuse) Tableau 1 : Comparaison entre la cellule procaryote et la cellule eucaryote Propriete Eucaryotes Procaryotes Representants Protozoaires, Algues, Champignons, animaux, vegetaux.Elles ont une des activites fondamentalement benefiques pour les autres organismes vivants, notamment par leur role d'acteurs du recyclage de la matiere organique et par leur implication dans de nombreux processus agroindustriels.Les organismes animaux tirent leur energie de l'oxydation de materiaux organiques, accumulent de substances de reserve sous forme de graisses ou de glycogene, sont animes de mouvements actifs ; ils sont aussi depourvus de paroi cellulaires.L'arbre phylogenetique du vivant La comparaison des ARN ribosomiques a permis de mettre en evidence trois domaines phylogenetiquement distincts qui sont les Bacteria, les Archaea et les Eukarya (eucaryotes) (figure 3).Cette opinion fut finalement mise en doute par le medecin italien Francisco Redi (1626-1697) qui realisa 1une serie d'experiences sur la viande en decomposition et la capacite de produire spontanement des asticots.Role des micro-organismes dans les maladies La relation micro-organismes-maladie fut loin d'etre evidente et il fallut des annees pour que les scientifiques etablissent le lien entre micro-organismes et developpement de maladies.Le philosophe romain Laucrece (a peu pres 98-55 av JC) et le medecin Girolamo Fracastoro (1478-1553) avaient suggere que des etres vivants invisibles provoquaient des maladies.Les Bacteria : Le domaine des Bacteria est extremement diversifie, comportant tous les procaryotes pathogenes connus a ce jour, ainsi que des centaines d'autres especes non pathogenes.La decouverte des microorganismes Meme avant la decouverte des micro-organismes, plusieurs chercheurs suspectaient l'existence et le role de ceux-ci dans les maladies.Une fois la relation etablit, les microbiologistes etudierent comment l'hote se defendait contre les micro-organismes et comment la maladie pouvait etre empechee : c'etait la naissance de l'immunologie.1.2..1.3.2.2.1.2.1.1.2.1.3.?


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  1. Historique
    Depuis la plus haute antiquité, les microorganismes ont été utilisés empiriquement pour
    produire et conserver les aliments. Actuellement, ils sont nécessaires à la production du
    pain, du fromage, de la bière, des antibiotiques, des vaccins, des vitamines, des enzymes et
    de beaucoup de produits importants
    Les microorganismes sont des acteurs indispensables de notre environnement et permettent
    aux cycles de carbone, de l’oxygène et du souffre de fonctionner dans les milieux terrestres
    et aquatiques ; ils sont à l’origine de toutes les chaines alimentaires. En revanche, les
    microorganismes causèrent des problèmes aux hommes et à la société depuis le début des
    temps historiques
    1.1. Définition
    LA MICROBIOLOGIE est un domaine d'études qui s'intéresse aux organismes de taille
    microscopique, Micro-organismes, aussi appelés microbes et protistes
    Forment un ensemble des êtres vivants invisible a l’œil nu, C’est leur seul point commun, car
    ils diffèrent et varient par leur morphologie, leur physiologie, leur mode de reproduction et
    leur écologie.
    1.2. La découverte des microorganismes
    Même avant la découverte des micro-organismes, plusieurs chercheurs suspectaient
    l’existence et le rôle de ceux-ci dans les maladies. Le philosophe romain Laucréce (à peu près
    98-55 av JC) et le médecin Girolamo Fracastoro (1478-1553) avaient suggéré que des êtres
    vivants invisibles provoquaient des maladies. Les premières observations au microscope
    furent sans doute réalisées entre 1625 et 1630.
    La découverte de micro-organismes nécessitait la fabrication d’un outil. C’est le Hollandais
    Antony Van Leeuwenhoek (1632-1723) qui conçut le microscope le plus simple, c'est-à-dire la
    loupe. . Les lentilles les plus fortes avaient un grandissement d’environ de 270. Van
    Leeuwenhoek révéla au monde scientifique la diversité des micro-organismes et l’incroyable
    richesse des milieux naturels, comme l’eau, en protozoaires, algues, levures, bactéries, qu’il
    les a ensuite appelés animalcules. Cependant, la physiologie de ces micro-organismes ne fut
    ni élucidé ni comprise. Ce n’est qu’en 1836, que fut véritablement interprétée la nature
    biologique des fermentations.
    1.3. Epoque Pastorienne
    1.3.1.Fermentations
    L’essor de la microbiologie au cours de la seconde moitié du XIXe siècle a été déclenché puis
    dominé par la génie de Louis Pasteur (1822-1895). Formé à la physique et à la chimie,
    Pasteur dès l’âge de 24 ans, découvre l’asymétrie moléculaire de l’acide tartrique. En 1854,
    alors qu’il est doyen de la faculté des sciences de Lille, il entreprend l’étude de la
    fermentation lactique. Il présente en 1857 son fameux mémoire ou il décrit le ferment
    lactique comme un organisme vivant, globuleux, beaucoup plus petit que la levure
    Pendant 20 ans, il poursuit inlassablement ses travaux sur d’autres fermentations (alcoolique
    en 1858, butyrique en 1861, acétique,….) et sur les maladies qui les affectent. Ces maladies
    sont dues à des contaminants que l’on peut détruire par chauffage à 56°C, procédé
    universellement connu sous le nom de pasteurisation
    1.3.2.Génération spontanée
    Pendant très longtemps, les gens crurent à la génération spontanée : les organismes vivants
    pouvant se développer à partir de matière non vivante ou en décomposition. Cette opinion
    fut finalement mise en doute par le médecin italien Francisco Redi (1626-1697) qui réalisa
    1une série d’expériences sur la viande en décomposition et la capacité de produire
    spontanément des asticots.
    Redi mit de la viande dans trois récipients. Le premier n’était pas couvert, le second était
    couvert de papier et le troisième d’une fine gaze qui pouvait écarter des mouches. Celles-ci
    déposèrent leurs œufs sur la viande non couverte et les asticots se développèrent. Les deux
    autres morceaux de viande ne produisirent pas spontanément d’asticots
    Figure 1 : Expériences de Redi
    Cependant, les mouches attirées par le récipient couvert de gaze pondirent leurs œufs
    sur la gaze ; mais ceux-ci ne se développèrent pas en larves. Ainsi, la production d’asticots par
    de la viande en décomposition était due à la présence d’œufs de mouches et la viande ne
    générait pas spontanément des asticots comme on le pensait précédemment
    1.1.1. Rôle des micro-organismes dans les maladies
    La relation micro-organismes-maladie fût loin d’être évidente et il fallut des années pour que
    les scientifiques établissent le lien entre micro-organismes et développement de maladies.
    Cette découverte dépendit fortement de progrès techniques. Une fois la relation établit, les
    microbiologistes étudièrent comment l’hôte se défendait contre les micro-organismes et
    comment la maladie pouvait être empêchée : c’était la naissance de l’immunologie.

  2. Place des microorganismes dans le monde vivant
    Avant la découverte des microorganismes tous les êtres vivants étaient classés à l’intérieur
    du règne animal ou du règne végétal. Les organismes animaux tirent leur énergie de
    l’oxydation de matériaux organiques, accumulent de substances de réserve sous forme de
    graisses ou de glycogène, sont animés de mouvements actifs ; ils sont aussi dépourvus de
    paroi cellulaires. Les végétaux, au contraire sont photosynthétiques, utilisent la lumière
    comme source d’énergie ; ils synthétisent de l’amidon comme réserve nutritive, sont
    dépourvus de mouvements et possèdent une paroi cellulaire. La découverte de ces formes
    vivantes microscopiques rendait de plus en plus difficile leur classement dans le règne animal
    ou végétal. Parmi elles, les algues et les champignons pouvaient être rapprochés de plantes,
    les premières à cause de leur pouvoir de photosynthèse, les seconds en raison de leur
    immobilité ; les protozoaires mobiles et non photosynthétiques étaient considérés comme
    des animaux ; la place des bactéries par contre restait à fixer
    2De très nombreux micro-organismes furent décrits durant le 18ème siècle et des tentatives
    de classification furent proposées. En 1886, le zoologiste allemand Haeckel proposa une
    solution logique en demandant la création, pour ses formes microscopiques, d’un troisième
    règne, celui des protistes (qui signifie « les tout premiers (Protistos) » en grec), qui rassemble
    les algues, les protozoaires, les champignons et les bactéries.
    2.1. L’arbre phylogénétique du vivant
    La comparaison des ARN ribosomiques a permis de mettre en évidence trois domaines
    phylogénétiquement distincts qui sont les Bacteria, les Archaea et les Eukarya (eucaryotes)
    (figure 3). Les deux premières lignées sont constituées uniquement de cellules procaryotes.
    Tandis que, la troisième contient exclusivement des eucaryotes.
    2.1.1. Les Eukarya
    Les microorganismes eucaryotes forment un monde immense et très diversifié. Ils ont tous
    un cadre fondamental commun : la complexité de leur organisation cellulaire, liée à de
    nombreux organites intra-cytoplasmiques spécialisés. La très grande majorité des
    microorganismes eucaryotes sont unicellulaires.
    Algues, Protozoaires, Mycètes (Champignons), Levures
    2.1.2. Les Archaea :
    Les archéobactéries tirent leur nom du grec arkhaios qui signifie « ancien ». Ce sont des
    bactéries singulières, connues depuis longtemps et jugées atypiques car différentes des
    Eubactéries par de nombreux caractères structuraux et physiologiques.
    2.1.3. Les Bacteria :
    Le domaine des Bacteria est extrêmement diversifié, comportant tous les procaryotes
    pathogènes connus à ce jour, ainsi que des centaines d’autres espèces non pathogènes. Les
    bactéries ont une structure essentiellement unicellulaire et sont les plus petits des protistes.
    Elles ont une des activités fondamentalement bénéfiques pour les autres organismes vivants,
    notamment par leur rôle d’acteurs du recyclage de la matière organique et par leur
    implication dans de nombreux processus agroindustriels. Grâce à leurs propriétés
    3physiologiques et écologiques très diversifiées, les bactéries prolifèrent dans tous les types
    d’écosystèmes aquatiques et terrestres et colonisent tous les végétaux et les animaux
    3.Caractéristiques générales de la cellule procaryote
    La comparaison entre les deux types cellulaires montre qu’il y’a des différences
    fondamentales entre cellule eucaryote et procaryote. En effet, la cellule eucaryote possède
    une structure plus complexe que la cellule procaryote et une taille de 1.000 à 10.000 fois plus
    importante. En effet, les cellules procaryotes sont structurellement beaucoup simples
    viennent d’être cités pour la cellule eucaryote.
    ✔ Aucune membrane interne ne sépare le contenu nucléaire du cytoplasme; aucune
    membrane interne ne sépare d’autres structures ou corps à l’intérieur de la cellule
    ✔ division cellulaire asexuée non par mitose
    ✔ Paroi cellulaire contient un type de molécule complexe appelée peptidoglycane;
    responsable de la rigidité structurale de la cellule
    ✔ Possede une membrane cytoplasmique
    ✔ Certain d’entres eux possèdent des flagelles ou une couche visqueuse
    (mucilagineuse)
    Tableau 1 : Comparaison entre la cellule procaryote et la cellule eucaryote
    Propriété Eucaryotes Procaryotes
    Représentants Protozoaires, Algues,
    Champignons, animaux,
    végétaux.
    Bactéries
    Matériel génétique Présence d’une membrane
    nucléaire ADN organisé en
    chromosomes ADN associé à
    des protéines (histones)
    Division mitotique Présence de
    nucléol
    Absence de membrane
    nucléaire ADN en un seul
    chromosome ADN nu Division
    amitotique Absence de
    nucléole


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